Reserva Ecologica Cacatachi Frente al Cambio Climatico (RECFRECC)

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martes, 25 de abril de 2017

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE LAS MOLÉCULAS EN LOS SERES VIVOS

Objetivo Fundamental
Caracterizar los principales componentes orgánicos e inorgánicos de la célula.
Concepto: la química de los organismos vivos es la química de los compuestos que contienen carbono o sea, los compuestos orgánicos.

Moléculas orgánicas son todas las moléculas que contienen C.
Una sola célula bacteriana puede tener más de cinco mil clases de moléculas. Una célula animal doble Compuestas de C H N O P S.

Se ha dicho que es suficiente reconocer cerca de 28 a 30 moléculas para tener un conocimiento que permita trabajar con la bioquímica de las células.
·         Dos de esas moléculas son los azúcares glucosa y ribosa;
·         Un lípido;
·         Veinte, aminoácidos biológicamente importantes; y
·         Cinco bases nitrogenadas, moléculas que contienen nitrógeno y son constituyentes claves de los nucleótidos.

El carbono es singularmente adecuado para este papel central, por el hecho de que es el átomo más liviano capaz de formar múltiples enlaces covalentes. A raíz de esta capacidad, el carbono puede combinarse con otros átomos de carbono y con átomos distintos para formar una gran variedad de cadenas fuertes y estables y de compuestos con forma de anillo.
Las moléculas orgánicas derivan sus configuraciones tridimensionales primordialmente de sus esqueletos de carbono. Sin embargo, muchas de sus propiedades específicas dependen de grupos funcionales. Una característica general de todos los compuestos orgánicos es que liberan energía cuando se oxidan.

Las moléculas que forman los Seres vivos pueden clasificarse en:

Inorgánicas: agua, sales minerales y algunos gases.
Orgánicas: Hidratos de carbono, Lípidos, Proteínas y Ácidos nucleicos.

Todas estas biomoléculas están organizadas en unas unidades superiores que son las células. Una célula es un recipiente, un recinto cerrado en cuyo interior se realizan las secuencias de reacciones químicas necesarias para la vida.

Una célula es un sistema capaz de mantener la concentración de algunas sustancias lo suficientemente alta como para que puedan producirse los procesos químicos que hacen posible que una célula realice todas sus funciones vitales. Por ello las células están rodeadas de membranas que retienen, o concentran de forma selectiva algunos compuestos químicos.

BIOMOLÉCULAS:

EL AGUA:

La vida, tal como la conocemos, tiene lugar en disolución acuosa. El agua es tan familiar que la consideramos generalmente como un fluido más bien poco activo de carácter simple. Se trata, sin embargo, de un líquido activo químicamente con propiedades físicas tan extraordinarias que si los químicos la hubiesen descubierto en épocas recientes, la habrían clasificado como una sustancia exótica.

Las propiedades del agua tienen un significado biológico profundo. Las estructuras de las moléculas en las que se basa la vida, las proteínas, los ácidos nucleicos, las membranas lipídicas y los hidratos de carbono complejos, son la consecuencia directa de sus interacciones con las moléculas de agua.

Átomos:  2 atomos de H, y uno de O




 


HIDRATOS DE CARBONO o CARBOHIDRATOS

Los carbohidratos o sacáridos (griego: Sakcharón, azúcar) son componentes esenciales de los organismos vivos y son, de hecho, la clase más abundante de las moléculas biológicas, además constituyen las principales moléculas de reserva energética que se encuentran en casi todos los seres vivos.

Componentes: monosacáridos (azúcar sencillo) con átomos: C, O, H

Para los sistemas vivos. Los más simples son
Los monosacáridos ("azúcares simples"). (p.ej. glucosa, fructosa, galactosa)
Los monosacáridos pueden combinarse para formar disacáridos ("dos azúcares") como la lactosa componente de la leche. (p.ej. maltosa (glu-glu), sacarosa (glu-fru), lactosa (glu-gal))
Polisacáridos (cadenas de muchos monosacáridos). (p.ej. almidón (amilosa), glicógeno (almidón animal), celulosa

Funciones:

Productor de energía: como azúcar y almidón (=reserva)
Estructural: pared de células vegetales (celulosa)
Reservorio de energía (Hígado y músculo) de uso rápido en organismos animales, incluyendo al hombre (glicógeno)
      


 Glucosa un monosacárido


            
 celulosa un polisacárido


 LÍPIDOS:

Son moléculas hidrofóbicas que, como los carbohidratos, almacenan energía y son importantes componentes estructurales. Incluyen las grasas y los aceites, los fosfolípidos, los glucolípidos, las ceras, y el colesterol y otros esteroides.

Se trata de un grupo de sustancias que tienen en común el no ser solubles en agua, por lo que forman agregados: Bicapa en membranas y gotas en el citoplasma pero sí son solubles en disolventes orgánicos apolares (benceno, acetona...), tienen un tacto untuoso y manchar el papel de forma característica.

Componentes:

Glicerina (Alcohol terciario)
Ácidos grasos (3 unidades)
Átomos: C, O, H, contienen menos oxígeno en relación al H y C, comparado con los azúcares.

Se presentan como: Grasas y aceites

Funciones:

Productor de energía y reserva de energía como grasa y aceite, ( de uso más lento que los carbohidratos)
Estructural: membranas celulares forman una Bicapa (fosfolípidos) impermeable a sustancias solubles en agua.
Térmica: aislante térmico.

También importante: Algunos ácidos grasos no pueden ser sintetizados por el cuerpo humano y deben ser ingeridos con el alimento. (Ácidos grasos esenciales). Ya que algunas vitaminas son solubles en grasa y solo pueden ser ingeridas con la grasa, no es posible evitar del todo la ingestión de grasa.





   
 Glicerol   fosfatidilcolina un fosfolípido


PROTEÍNAS:

Son moléculas muy grandes compuestas de cadenas largas de aminoácidos, conocidas como cadenas polipeptídicas. A partir de sólo veinte aminoácidos diferentes usados para hacer proteínas se puede sintetizar una inmensa variedad de diferentes tipos de moléculas proteínicas, cada una de las cuales cumple una función altamente específica en los sistemas vivos. Son sustancias que componen las estructuras celulares y las herramientas que hacen posible las reacciones químicas del metabolismo celular.

Componentes: Aminoácidos (20 variedades distintas)

Átomos: C, O, H, N, S

Se presentan como:

Dipéptidos, (conformados por 2 aminoácidos)
Oligopéptidos (más de 10 aminoácidos) y
Proteínas (más de 100 aminoácidos)

Funciones:

Estructural: por ejemplo en la musculatura, en el tejido conjuntivo, en las membranas celulares.
Enzimática (biocatalizadores) en todos los procesos metabólicos.
Defensa: Inmunoglobulinas (por ejemplo en el combate de infecciones) = anticuerpos.
Hormonal: (sustancias mensajeras).
Receptora: detección de estímulos en la superficie celular.
Glicina un aminoácido 

 
                                                     ubiquitina una proteína

ÁCIDOS NUCLEICOS:

Una característica esencial de los seres vivos es su capacidad para reproducirse. Para ello cada individuo debe contener una descripción completa de sí mismo, que además ha de ser capaz de transmitir a sus descendientes para que ellos puedan construir otro individuo con esas características. A nivel celular, una célula ha de disponer de esas instrucciones para construir una réplica idéntica de sí misma. En una célula, esa información se encuentra en el ácido desoxirribonucleico (ADN). El ADN tiene la particularidad de que posee información también para hacer copias de sí mismo. Para que la información contenida en el  ADN se pueda expresar hace falta otra sustancia que es el ácido ribonucleico (ARN).

Son moléculas complejas formadas por un grupo fosfato, un azúcar de cinco carbonos y una base nitrogenada. Son los bloques estructurales de los ácidos desoxirribonucleico (DNA) y ribonucleico (RNA), que transmiten y traducen la información genética. Los nucleótidos también desempeñan papeles centrales en los intercambios de energía que acompañan a las reacciones químicas dentro de los sistemas vivos.

El principal portador de energía en la mayoría de las reacciones químicas que ocurren dentro de las células es un nucleótido que lleva tres fosfatos, el ATP.

Constituidos por:
Nucleótidos (compuestos de fosfato, ribosa o desoxirribosa [azúcar] y base nitrogenada [Base púrica o pirimídica]

Átomos: C, O, N, H, P

Se presentan como:

Ácido desoxirribonucleico, ADN, ADN con las bases adenina, timina, citosina, guanina, siempre de doble cadena en el núcleo celular
Ácido ribonucleico ARN, ARN con las bases adenina, uracilo, citosina y guanina, de cadena sencilla, solo excepcionalmente de doble cadena; como ARN-mensajero en el núcleo celular y citoplasma, como ARN-de transferencia en el citoplasma, como ARN-ribosomal en el citoplasma

Funciones:
Almacenamiento de la información hereditaria, ADN
Síntesis proteica: ARN- mensajero, ARN-de transferencia, ARN-ribosomal
Comparación:

ADN: desoxirribosa, timina, doble cadena

ARN: ribosa, uracilo en lugar de timina cadena sencilla.
                                                    Doble cadena de ADN



PAPEL CENTRAL DEL CARBONO
Puede formar 4 enlaces covalentes con cuatro átomos diferentes y entre si Una molécula orgánica deriva su configuración final de la disposición de sus átomos de C, esqueleto. De la configuración depende las propiedades y función dentro de los sistemas vivos.
Hidrocarburos, compuestos formados solo por C e H, estructuralmente son el tipo más simple de moléculas orgánicas Derivan de los restos de organismos que murieron hace millones de años. Son de poca importancia en organismos vivos, pero de estos sale gasolina, etc.

Grupos funcionales
Determinan las propiedades químicas de las moléculas orgánicas Unidos al esqueleto de C, reemplazando a uno o más de los H presentes en el hidrocarburo.

Ejm. Grupo –OH (hidroxilo). Cuando un H y un O se unen covalentemente, un e exterior del O sobra, queda no apareado, no compartido, puede entonces ser compartido con un electrón exterior que, de modo semejante, quedo disponible en una átomo de C, formando así un enlace covalente con el C.
Conocer los grupos funcionales facilita reconocer moléculas particulares y predecir sus propiedades.
Ej. Grupo carboxilo –COOH, propiedades de ácido 
Alcoholes, con sus grupos hidroxilos polares, tienden a ser solubles en agua Metilo, grupos funcionales no polares, insolubles en agua.
Aldehído asociados con olores y sabores acres. Formaldehido. Mayoría de grupos funcionales son polares y confieren solubilidad en agua.

ISÓMEROS Y ACTIVIDAD BIOLÓGICA
Isómeros son compuestos cuya fórmula química es igual, pero diferente en disposición de átomos Isómeros estructurales: igual forma molecular, pero diferente forma de unión entre átomos.
Estos difieren en sus propiedades químicas. Isómeros ópticos o enantiómeros: moléculas idénticas excepto en su geometría tridimensional, “espejo”.
Todos los aa se presentan en dos formas, los dos isómeros ópticos, llamados forma L y forma D. Solo los aa L se encuentran comunmente en las proteínas de los seres vivos

EL FACTOR ENERGÉTICO
Los Enlaces covalentes que se encuentran comúnmente en las moléculas orgánicas, son enlaces fuertes y estables, sus electrones se mueven alrededor de dos o más núcleos atómicos. Estos enlaces pueden romperse por fuentes de energía, kilocalorías, y después pueden volver a formar la misma molécula o una diferente, lo cual depende de varios factores: la temperatura, la presión y los átomos que estén disponibles.


Dependiendo de las fuerzas relativas de los enlaces rotos y de los formados se liberará o se obtendrá energía del medio circundante. Los seres vivos utilizan enzimas para minimizar el uso de energía.

1.-CARACTERISTISTICAS FUNDAMENTALES DE LOS SISTEMAS BIOLÓGICOS

NIVELES DE ORGANIZACIÓN BIOLÓGICA.
Un análisis químico de los elementos constituyentes de todos los seres vivos conocidos revelaría que casi todos de ellos están formados por cuatro elementos químicos principales o elementales y algunos otros secundarios.

Si los elementos químicos de los seres vivos están presentes en el planeta la proporción en que se encuentran es diferente, e inculco diferente a la de la corteza terrestre, que es el medio donde se desarrolla.

De todos los elementos que se hallan en la corteza sólo 70 son componentes de los seres vivos (Se denominan elementos biogénicos o bioelementos) y de estos sólo 16 son comunes a todos ellos.

Se agrupan en tres categorías:
.Bioelementos principales C, H, O, N.
.Bioelementos secundarios: S, P, Mg, Ca, Na, K, Cl
.Oligoelementos

3.- BIOELEMENTOS Y BIOMOLECULAS.
Un análisis químico de los elementos que constituyen la materia viva conocidos revelaría que casi todos están formados cualitativa y cuantitativamente por lo mismos elementos.
Comparando la proporción en masa de los distintos elementos químicos en la TIERRA, CORTEZA Y SERES VIVOS llegamos a las siguientes conclusiones:

-Si bien los elementos químicos que forman los seres vivos están presentes en el planeta la proporción en la que se encuentra es diferente, incluso diferente a la de la corteza que es el medio en el que se desarrolla la vida esto nos indica que los seres vivos han seleccionado aquello elementos que son mas idóneos para su estructura y sus funciones.

-De todos los elementos que se encuentra en la corteza solo 70 son componentes de los seres vivos y de ellos solo 16 son comunes a todos los seres vivos esto nos confirma la idea de que la vida se ha desarrollado sobre unos elementos concretos no por azar sino porque esos elementos poseen unas propiedades físico-química que los hacen idóneos en los procesos químicos que se desarrollan en los seres vivos.

En el 99% del cuerpo de los organismos conocidos solo están presentes 6 de los elementos existentes en la tierra. El cuerpo humano, por ejemplo, está mayoritariamente por los elementos de Carbono (C), Oxígeno (O), Hidrógeno (H), Nitrógeno (N), Fósforo (P) y Azufre (S).  Por otro lado, si se compara la composición química de los seres vivos con la del medio físico, se puede notar que los principales elementos que componen a los seres vivos no son los que más abundan en la corteza terrestre (que no incluye ni a la atmósfera ni a los mares). Es decir que, si bien los seres vivos y los entes inanimados están formados por los mismos componentes químicos, la diferencia entre ellos radica en el modo en que se organiza la materia que los constituye (Ver recuadro 1 y 2).
ELEMENTO QUIMICO
SIMBOLO
% EN LOS SERES VIVOS
% EN LA CORTEZA
Carbono
C
18.5
0.19
Hidrogeno
H
9.5
0.8
Oxigeno
O
65
46
Nitrógeno
N
3.3

Sodio
Na

2
Potasio
K
0.2
2.4
Calcio
Ca
1.5
3
Magnesio
Mg
4
4
Hierro
Fe

6
Silicio
Si

28
Aluminio
Al

8
Fosforo
P
1

Azufre
S
0.3

Cloro
Cl
0.1



Los bioelementos o elementos biogénicos son aquellos elementos químicas que forman parte de los seres vivos, en la actualidad se han identificado unos 70.
Se pueden clasificar en dos grupos:

Bioelementos primarios: Son indispensables para la formación de biomoleculas orgánicas: Glucidos, Lípidos, Proteínas y Ácidos nucleicos. El 95 % del total de la materia viva C,H,O,N,P,S.

Bioelementos secundarios: (Resto) se dividen en:
-Indispensables: son Ca, Na, K, Mg, Cl, Fe, Si, Cu, Mn, B, F, I.
-Variables: son Br, Zn, Ti, V, Pb.
Los bioelementos indispensables no pueden faltar en algunos organismos, existe otra clasificación, que esta basada en su importancia y es que divide a los bioelementos en bioelementos plásticos y

Oligoelementos.
Los oligoelementos: Fe, Cu, Mg se denominan de esta forma al conjunto de elementos químicos que están presentes en la materia viva en proporciones inferiores al 0,5%.
Se han aislado 60 oligoelementos en los cuales 14 son comunes para todos los seres vivos estos son oligoelementos esenciales y son: Mn, Zn, F, I, B, Fe, Cu, Mg, Si, V, Cr, Co, Se,Mo, Sn.

Las razones por las que los bioelementos mayoritarios forman parte prácticamente todas las moléculas son las siguientes:
-los seis elementos C, H, O, N, P, S tienen capas electrónicas externas incompletas de este modo pueden formar fácilmente enlaces covalentes compartiendo pares de electrones dando lugar a todas las biomoleculas: estructuras y funciones vitales.
-Estos elementos poseen un numero atómico bajo por lo que electrones compartidos en la formación de enlaces originadas son muy estables.
-Dado que el O y N son electronegativas muchas biomoleculas son polares y para ello solubles en agua que es el medio que tienen lugar todas las reacciones celulares.
Los bioelementos mayoritarios pueden incompararse fácilmente a los seres vivos desde el medio externo CO2, H2O Nitratos, NO3- esto asegura el intercambio constante de materia entre los organismos vivos y su ambiente
Los bioelementos se combinan entre si formando moléculas mas o menos complejas que reciben el nombre de biomoleculas o principios inmediatos desde el punto de vista químico. Se clasifica en: inorgánicas y orgánicas.


Las biomoleculas inorgánicas
Pueden encontrarse fuera de los seres vivos, tienen una estructura química sencilla y las orgánicas son exclusivas de los seres vivos.
Agua
Sales Minerales

Biomoleculas Orgánicas
Glúcidos
Lípidos
Proteínas
Ácidos Nucleicos

AGUA

1.- ESTRUCTURA
la molécula del agua está formada por dos átomos de hidrógeno unidos a un átomo de oxígeno mediante sendos enlaces covalentes polares.
A pesar de ser eléctricamente neutra, la molécula de agua es dipolar, ya que posee una región electropositiva y otra electronegativa, esto es debido a que el átomo de oxígeno, al ser más electronegativo que le átomo de oxígeno, al ser más electronegativo que el de hidrógeno.

Al estructura dipolar de la molécula de agua hace que estas puedan atraerse entre sí, porque el oxígeno de una molécula puede interaccionar con el hidrógeno de otra estableciendo lo que se denomina enlace o puentes de hidrógeno, que es una interacción debil en comparación con enlace covalente o iónico.
El agua pura posee la capacidad de disociarse en iones, lo que hace que en realidad, sea una mezcla de tres especies.
Como en el agua pura la concentración de hidrógeno y de hidroxilos es la misma, eso significa que la concentración de hidrogeniones es de 1,0 * 10-7.
Cuando el agua contiene cualquier sustancia disuelta, puede alterarse la concentración de hidrogeniones y entonces se utilizan los términos de acidez y alcalinidad.
Para simplificar los cálculos y las notaciones Sörensen ideó expresar dichas concentraciones utilizando logaritmos y así definiciones el Ph como el logaritmo cambiado de signo de la concentración de hidrogeniones según esto:
-Disolución neutra: Ph =7
-Disolución ácida: Ph<7
-Disolución alcalina o básica: Ph >7
Es conveniente que le Ph de sus fluidos no cambie bruscamente pues, eso podría ocasionar el cambio de estructuras de muchas biomoléculas o la alteración de muchas reacciones químicas, para ello en las soluciones acuosas de los seres vivos están presentes los llamados sistemas tampón o amortiguadores de Ph.
El tampón bicarbonato es común en los líquidos intercelulares, mantienen el Ph en valores próximos a 7,4.
El tampón fosfato se encuentra en los líquidos intracelulares y mantiene el Ph en torno a 6,86 debido al equilibrio entre los fosfatos monobásico y dibásico.

2.- PROPIEDADES FISICO-QUIMICAS DEL AGUA Y FUNCIONES BIOLÓGICAS
Propiedades físico-químico entre ellas se pueden citar:

-Elevado calor de vaporización, el agua cuando cambia del estado líquido al gaseoso, ha de romper todos los enlaces de hidrógeno que mantienen unidas sus moléculas y para ellos se necesita una gran cantidad.

-Elevado calor específico: Los puentes de hidrógeno entre las moléculas de agua liberan energía cuando se forman y la absorven cuando se destruyen.

-Elevado momento dipolar: El carácter dipolar de la molécula de agua explica también la propiedad de ser un disolvente casi universal para todo tipo de sustancias iónicas.

-Elevada fuerza de cohesión: Los puentes de hidrógeno, aunque se forman y se rompen constantemente mantienen juntas las moléculas de agua. Ello permite que el agua forme columnas continuas o que su superficie oponga una gran resistencia a romperse ( elevada tensión superficial), convirtiéndose así en un líquido prácticamente incomprensible, lubricante y poco viscoso.
Funciones biológicas

-Función termoreguladora: El elevado calor específico del agua la convierte en un buen amortiguador térmico, impidiendo que los cambios bruscos de temperatura externa afecten a los organismos.

-Función disolventes: La naturaleza dipolar de la molécula del agua la convierte en un disolvente casi universal ya que es capaz de disolver gran cantidad de sustancias polares e incluso no polares.

-Función estructural: La elevada fuerza de cohesión-adhesión que existe entre las moléculas de agua, permite que se mantengan la forma y el volumen de la s células.

-Función mecánica: El agua, al disolver diversas sustancias y a diversas concentraciones, produce líquidos con la viscosidad adecuada para actuar de lubricantes y amortiguadores de movimientos bruscos en articulaciones, músculos....

-Función química: La disociación iónica del agua le permite intervenir en muchas reacciones químicas, aportando hidrogeniones o hidroxilos.

3.-DISOLUCIONES ACUOSAS DE SALES MINERALES

Funciones de las sales en disolución:
Cumplen funciones de tipo general, colaborando en el mantenimiento de la homeostasis o equilibrio del medio interno;
.Mantener el grado de salinidad
.Regular la actividad enzimática
.Regular la presión osmótica y el volumen celular
.Generar potenciales eléctricos
.Regulación del Ph.

La ósmosis es un fenómeno en el que se produce el paso o difusión de disolventes a través de una membrana semipermeables desde una disolución más diluida a otra más concentrada.
Los medios acuoso se denominan:
-Hipertónicos a los que tienen elevada concentración de solutos con respecto a otro.

-Hipotónicos: A los que contienen una concentración de solutos baja hacia los hipertónicos.